金融创新会带来的监管问题有很多，大致上有几个方面：
第一个方面是如何认定是金融创新？很多创新，期初并不是主打金融，例如所谓的“金融科技”，其原意是通过互联网技术创新，让金融更加普及。但是做着做着，这些互联网企业变身为金融企业，其表现是他们开始自己发放贷款。这就成为真正的“金融创新”而不是“技术创新”了。所以监管第一个问题是，如何准确判断是否属于金融创新。
第二个方面是何时介入对金融创新的监管？像银行那些持证机构就比较好管，很多创新是需要经过监管批准的，所以监管是事先介入。但是很多非银行金融机构，他们的创新则不在某个单一的监管部门责权之内，例如此前曾经流行一时的通道业务，银行-信托-券商或基金组盘，监管部门都不认为是属于自己责权范围内。又例如那些“互联网金融企业”，发放现金贷、搞P2P，他们不是传统意义上的金融机构，但又从事着金融活动，等到监管真正介入时早已一地鸡毛。所以，监管介入的时机是十分难以把握的。
第三个方面是用什么手段进行监管？金融在创新，监管手段也要创新，但问题是监管手段的创新速度跟不上金融创新速度。现在金融创新的速度是相当快的，监管机构发现问题症结需要时间来验证，验证完了又需要花时间出台对应政策和监管方法，所以往往落后于金融创新而速度，而落后的监管手段又给了金融创新更多的创新空间。
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