首先，利润大不是跟没有进项发票有关，是跟成本发票有关。不过没有进项发票，也可能引起多交增值税。
1. 一般制造业和商贸企业的利润率不会是特别高的，因为采购成本放在那里。如果没有取得合理的成本发票，那么有可能会造成利润大。这个时候可以从几个方面来考虑是否可行：
（1） 对供应商的选择，选取有资质能开发票的供应商。对于想合作但供应商又不愿意开票的，可以看看供应商这里能不能进行税收的筹划，一般如果不会增加其成本，又有利于其长期发展的，也许供应商会考虑。
（2） 对供应链的改变，延长或者缩短供应链。比如，有很多散户供应商，那么可以考虑成立一个小规模或者个独来跟他们对接，这个对接的企业用核定所得税，同时也可以开出增值税票给自己的主体企业来抵扣和进成本。再匡算下整体的成本看看可行性。
（3） 对企业规模的改变。目前小微企业是有比较大的税率优惠的，那么可以看看企业是否可以适当改变规模以符合小微企业的要求，这样可以从税率上获得一定优惠。
2. 对于轻资产的服务类企业是比较容易出现利润大这个状况的。原因就是其他的进项不多，大头在人力成本。
（1） 社保和所得税的权衡。对于企业自己的员工而言，发高工资就意味着高社保，很多企业都觉得这块成本是难以承受的重负。但如果工资低了，利润就有可能高，那么就面临交更多所得税的问题。还好，今年马上要降低社保费率了。建议企业合理筹划职工的工资薪金结构，保障职工福利的同时，也不会面临利润过高的问题。
（2） 个税和所得税间的权衡。对于一些行业，很多时候都要外聘人员，比如来做个演出、讲座、做个咨询项目等等，这个时候就面临劳务报酬过高，不愿意开票的问题。那么，其实今年的新的个税方法在这个问题上是有很大改善的，因为最后按照综合所得纳税，还有各项扣除，比过去的直接上20%-40%的税率应该是有下降的。此外，像经常合作的这些人员，有企业的（个独、合伙等）最好都以企业的名义来跟公司结算，那么公司就更容易获得成本发票，对方在税收上也可能较优。
这里粗略说了一些，最好的回答肯定是能结合企业的实际情况才行。
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